Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H2

Trbv13-3, T cell receptor beta, variable 13-3 (Fragment), mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-3A0A0B4J1H2 1700024I08Rik-203ENSMUST00000222372 754 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm19786-201ENSMUST00000222589 580 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 AC160984.2-201ENSMUST00000224927 791 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Olfr998-201ENSMUST00000052307 1012 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm21994-201ENSMUST00000063463 990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Olfr566-201ENSMUST00000071393 951 ntAPPRIS P2 BASIC2.56□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Olfr919-201ENSMUST00000071425 948 ntAPPRIS P2 BASIC2.56□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm23628-201ENSMUST00000082464 173 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm22304-201ENSMUST00000082688 129 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm44562-201ENSMUST00000207194 1347 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Vmn1r10-202ENSMUST00000228270 2084 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm43379-201ENSMUST00000196253 7726 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pak3-205ENSMUST00000112868 8163 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Prl2c2-201ENSMUST00000110594 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm16400-201ENSMUST00000116523 1029 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm22676-201ENSMUST00000116972 129 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rpl38-ps1-201ENSMUST00000117723 215 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Olfr1165-ps-201ENSMUST00000117860 950 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm13567-201ENSMUST00000118026 247 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm14541-201ENSMUST00000118985 157 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm11881-201ENSMUST00000119408 572 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mrpl1-203ENSMUST00000121477 1550 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm6938-201ENSMUST00000123014 771 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Usp46os1-201ENSMUST00000129275 508 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 2810403D21Rik-203ENSMUST00000131640 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm16331-201ENSMUST00000144274 498 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm23112-201ENSMUST00000158606 125 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm23773-201ENSMUST00000158985 296 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm3123-201ENSMUST00000163480 480 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Vmn1r-ps65-201ENSMUST00000174235 951 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm23365-201ENSMUST00000175019 125 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm25960-201ENSMUST00000175110 125 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm44453-201ENSMUST00000175161 126 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm25195-201ENSMUST00000177656 126 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm20826-201ENSMUST00000179256 758 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm26824-201ENSMUST00000180506 1164 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rp31-ps19-201ENSMUST00000180929 353 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Prl8a8-201ENSMUST00000018389 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sprr2g-202ENSMUST00000189634 651 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm6757-201ENSMUST00000189810 1706 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 1700020G17Rik-204ENSMUST00000191429 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm37708-201ENSMUST00000192337 895 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm29730-201ENSMUST00000192986 1396 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm42567-201ENSMUST00000199268 352 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm43227-201ENSMUST00000202239 677 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rab5a-ps-201ENSMUST00000203252 653 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 4930587E11Rik-202ENSMUST00000204857 807 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Clhc1-204ENSMUST00000208530 2062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm45553-201ENSMUST00000209929 507 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Olfr59-204ENSMUST00000214048 3363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm30738-201ENSMUST00000221346 502 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm10811-201ENSMUST00000221985 2448 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 AC140344.1-201ENSMUST00000223384 387 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 AC107663.3-201ENSMUST00000225873 601 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Casp12-201ENSMUST00000027009 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm7257-201ENSMUST00000041537 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Olfr902-201ENSMUST00000050733 1056 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sprr2g-201ENSMUST00000056590 650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Olfr1151-201ENSMUST00000061081 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tex16-201ENSMUST00000038546 3972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mcmdc2-204ENSMUST00000140948 3249 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm13103-201ENSMUST00000094522 1833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm42701-201ENSMUST00000196117 1657 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zfp946-204ENSMUST00000167740 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 AC153881.3-201ENSMUST00000218494 1561 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm42768-201ENSMUST00000197734 2897 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Olfr747-204ENSMUST00000213238 1416 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Smim9-201ENSMUST00000101433 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Trav15-1-dv6-1-201ENSMUST00000103653 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.54□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm3443-201ENSMUST00000112772 285 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm14050-201ENSMUST00000117052 346 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm11898-201ENSMUST00000117161 385 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hmgb1-rs18-201ENSMUST00000117940 627 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm12294-201ENSMUST00000119723 490 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm7363-201ENSMUST00000119883 399 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm11876-201ENSMUST00000120002 269 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm11704-201ENSMUST00000120031 214 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm15244-201ENSMUST00000121122 130 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm14581-201ENSMUST00000121726 198 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm11233-201ENSMUST00000122357 634 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm22208-201ENSMUST00000122658 110 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm14902-201ENSMUST00000145576 1007 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm23098-201ENSMUST00000157552 299 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm22789-201ENSMUST00000157884 130 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm24213-201ENSMUST00000158255 258 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Clec9a-203ENSMUST00000164513 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Olfr758-ps1-201ENSMUST00000173901 841 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mir5098-201ENSMUST00000175320 82 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Vmn1r-ps146-201ENSMUST00000176131 525 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm27033-201ENSMUST00000183226 544 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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