Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP8

Vmn1r10, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r10W4VSP8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r10W4VSP8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r10W4VSP8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r10W4VSP8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r10W4VSP8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r10W4VSP8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r10W4VSP8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r10W4VSP8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r10W4VSP8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r10W4VSP8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r10W4VSP8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r10W4VSP8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r10W4VSP8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r10W4VSP8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r10W4VSP8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r10W4VSP8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r10W4VSP8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r10W4VSP8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r10W4VSP8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r10W4VSP8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r10W4VSP8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r10W4VSP8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r10W4VSP8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r10W4VSP8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r10W4VSP8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r10W4VSP8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r10W4VSP8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r10W4VSP8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r10W4VSP8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r10W4VSP8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r10W4VSP8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r10W4VSP8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r10W4VSP8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r10W4VSP8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r10W4VSP8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r10W4VSP8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r10W4VSP8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r10W4VSP8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r10W4VSP8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r10W4VSP8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r10W4VSP8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r10W4VSP8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r10W4VSP8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r10W4VSP8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r10W4VSP8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r10W4VSP8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r10W4VSP8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r10W4VSP8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r10W4VSP8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r10W4VSP8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r10W4VSP8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r10W4VSP8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r10W4VSP8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r10W4VSP8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r10W4VSP8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r10W4VSP8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r10W4VSP8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r10W4VSP8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r10W4VSP8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r10W4VSP8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r10W4VSP8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r10W4VSP8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r10W4VSP8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r10W4VSP8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r10W4VSP8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r10W4VSP8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r10W4VSP8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r10W4VSP8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r10W4VSP8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r10W4VSP8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r10W4VSP8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r10W4VSP8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r10W4VSP8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r10W4VSP8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r10W4VSP8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r10W4VSP8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r10W4VSP8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r10W4VSP8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r10W4VSP8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r10W4VSP8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r10W4VSP8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r10W4VSP8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r10W4VSP8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r10W4VSP8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r10W4VSP8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r10W4VSP8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r10W4VSP8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r10W4VSP8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r10W4VSP8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r10W4VSP8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r10W4VSP8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r10W4VSP8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r10W4VSP8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r10W4VSP8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r10W4VSP8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r10W4VSP8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r10W4VSP8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r10W4VSP8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r10W4VSP8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r10W4VSP8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms