Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hdac5Q9Z2V6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hdac5Q9Z2V6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hdac5Q9Z2V6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hdac5Q9Z2V6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hdac5Q9Z2V6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hdac5Q9Z2V6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hdac5Q9Z2V6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hdac5Q9Z2V6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hdac5Q9Z2V6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hdac5Q9Z2V6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms