Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T2

Thbs4, Thrombospondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs4Q9Z1T2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thbs4Q9Z1T2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thbs4Q9Z1T2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thbs4Q9Z1T2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thbs4Q9Z1T2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thbs4Q9Z1T2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thbs4Q9Z1T2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thbs4Q9Z1T2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thbs4Q9Z1T2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Thbs4Q9Z1T2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thbs4Q9Z1T2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thbs4Q9Z1T2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Thbs4Q9Z1T2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thbs4Q9Z1T2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Thbs4Q9Z1T2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thbs4Q9Z1T2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms