Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms