Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms