Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AireQ9Z0E3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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