Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL1

Ap4s1, AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1Q9WVL1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms