Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms