Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms