Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhx6Q9R1R0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lhx6Q9R1R0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lhx6Q9R1R0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lhx6Q9R1R0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lhx6Q9R1R0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx6Q9R1R0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx6Q9R1R0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx6Q9R1R0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx6Q9R1R0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx6Q9R1R0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx6Q9R1R0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx6Q9R1R0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx6Q9R1R0 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx6Q9R1R0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx6Q9R1R0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx6Q9R1R0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx6Q9R1R0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx6Q9R1R0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx6Q9R1R0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx6Q9R1R0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx6Q9R1R0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx6Q9R1R0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx6Q9R1R0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx6Q9R1R0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx6Q9R1R0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx6Q9R1R0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhx6Q9R1R0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhx6Q9R1R0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhx6Q9R1R0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhx6Q9R1R0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhx6Q9R1R0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhx6Q9R1R0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhx6Q9R1R0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhx6Q9R1R0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhx6Q9R1R0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhx6Q9R1R0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhx6Q9R1R0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhx6Q9R1R0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms