Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms