Protein–RNA interactions for Protein: Q9R061

Nubp2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp2Q9R061 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nubp2Q9R061 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms