Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp11cQ9QZW0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp11cQ9QZW0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp11cQ9QZW0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp11cQ9QZW0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp11cQ9QZW0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp11cQ9QZW0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp11cQ9QZW0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp11cQ9QZW0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp11cQ9QZW0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp11cQ9QZW0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp11cQ9QZW0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp11cQ9QZW0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp11cQ9QZW0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp11cQ9QZW0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp11cQ9QZW0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp11cQ9QZW0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp11cQ9QZW0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp11cQ9QZW0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp11cQ9QZW0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp11cQ9QZW0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp11cQ9QZW0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp11cQ9QZW0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp11cQ9QZW0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp11cQ9QZW0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp11cQ9QZW0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp11cQ9QZW0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp11cQ9QZW0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp11cQ9QZW0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp11cQ9QZW0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp11cQ9QZW0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp11cQ9QZW0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp11cQ9QZW0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp11cQ9QZW0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp11cQ9QZW0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp11cQ9QZW0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp11cQ9QZW0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp11cQ9QZW0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp11cQ9QZW0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp11cQ9QZW0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp11cQ9QZW0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp11cQ9QZW0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp11cQ9QZW0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp11cQ9QZW0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp11cQ9QZW0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp11cQ9QZW0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp11cQ9QZW0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp11cQ9QZW0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp11cQ9QZW0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp11cQ9QZW0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp11cQ9QZW0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp11cQ9QZW0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp11cQ9QZW0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp11cQ9QZW0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp11cQ9QZW0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp11cQ9QZW0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms