Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms