Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms