Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxe3Q9QY14 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
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