Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms