Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms