Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMC3

Dnaja4, DnaJ homolog subfamily A member 4, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja4Q9JMC3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnaja4Q9JMC3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms