Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prg4Q9JM99 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prg4Q9JM99 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prg4Q9JM99 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prg4Q9JM99 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prg4Q9JM99 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prg4Q9JM99 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prg4Q9JM99 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prg4Q9JM99 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prg4Q9JM99 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prg4Q9JM99 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Prg4Q9JM99 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prg4Q9JM99 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prg4Q9JM99 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prg4Q9JM99 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prg4Q9JM99 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prg4Q9JM99 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prg4Q9JM99 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prg4Q9JM99 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prg4Q9JM99 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms