Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Higd1aQ9JLR9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Higd1aQ9JLR9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Higd1aQ9JLR9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1aQ9JLR9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1aQ9JLR9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1aQ9JLR9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1aQ9JLR9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1aQ9JLR9 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1aQ9JLR9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1aQ9JLR9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1aQ9JLR9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1aQ9JLR9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1aQ9JLR9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1aQ9JLR9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1aQ9JLR9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1aQ9JLR9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1aQ9JLR9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1aQ9JLR9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1aQ9JLR9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1aQ9JLR9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1aQ9JLR9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1aQ9JLR9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1aQ9JLR9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1aQ9JLR9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1aQ9JLR9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1aQ9JLR9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1aQ9JLR9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1aQ9JLR9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1aQ9JLR9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1aQ9JLR9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1aQ9JLR9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1aQ9JLR9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1aQ9JLR9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1aQ9JLR9 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1aQ9JLR9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Higd1aQ9JLR9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Higd1aQ9JLR9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Higd1aQ9JLR9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Higd1aQ9JLR9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Higd1aQ9JLR9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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