Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms