Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gde1Q9JL56 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gde1Q9JL56 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gde1Q9JL56 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gde1Q9JL56 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gde1Q9JL56 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gde1Q9JL56 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gde1Q9JL56 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gde1Q9JL56 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gde1Q9JL56 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gde1Q9JL56 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gde1Q9JL56 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gde1Q9JL56 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gde1Q9JL56 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gde1Q9JL56 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gde1Q9JL56 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gde1Q9JL56 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gde1Q9JL56 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gde1Q9JL56 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gde1Q9JL56 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gde1Q9JL56 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gde1Q9JL56 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gde1Q9JL56 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gde1Q9JL56 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gde1Q9JL56 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gde1Q9JL56 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gde1Q9JL56 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gde1Q9JL56 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gde1Q9JL56 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gde1Q9JL56 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gde1Q9JL56 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gde1Q9JL56 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gde1Q9JL56 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gde1Q9JL56 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms