Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms