Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms