Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJQ0

Pigb, GPI mannosyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PigbQ9JJQ0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PigbQ9JJQ0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PigbQ9JJQ0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PigbQ9JJQ0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PigbQ9JJQ0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PigbQ9JJQ0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PigbQ9JJQ0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PigbQ9JJQ0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PigbQ9JJQ0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PigbQ9JJQ0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PigbQ9JJQ0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PigbQ9JJQ0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PigbQ9JJQ0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PigbQ9JJQ0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms