Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 268.8 ms