Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms