Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR5

Lime1, Lck-interacting transmembrane adapter 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lime1Q9EQR5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lime1Q9EQR5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lime1Q9EQR5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lime1Q9EQR5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lime1Q9EQR5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lime1Q9EQR5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Lime1Q9EQR5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lime1Q9EQR5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Lime1Q9EQR5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lime1Q9EQR5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lime1Q9EQR5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lime1Q9EQR5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lime1Q9EQR5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lime1Q9EQR5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lime1Q9EQR5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lime1Q9EQR5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lime1Q9EQR5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lime1Q9EQR5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lime1Q9EQR5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lime1Q9EQR5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lime1Q9EQR5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lime1Q9EQR5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lime1Q9EQR5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lime1Q9EQR5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lime1Q9EQR5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lime1Q9EQR5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lime1Q9EQR5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lime1Q9EQR5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lime1Q9EQR5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lime1Q9EQR5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lime1Q9EQR5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lime1Q9EQR5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lime1Q9EQR5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lime1Q9EQR5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lime1Q9EQR5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lime1Q9EQR5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lime1Q9EQR5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms