Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mrpl4Q9DCU6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mrpl4Q9DCU6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mrpl4Q9DCU6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mrpl4Q9DCU6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mrpl4Q9DCU6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mrpl4Q9DCU6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mrpl4Q9DCU6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mrpl4Q9DCU6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mrpl4Q9DCU6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mrpl4Q9DCU6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mrpl4Q9DCU6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mrpl4Q9DCU6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mrpl4Q9DCU6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mrpl4Q9DCU6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mrpl4Q9DCU6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mrpl4Q9DCU6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms