Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tspan4Q9DCK3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Tspan4Q9DCK3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Tspan4Q9DCK3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Tspan4Q9DCK3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Tspan4Q9DCK3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Tspan4Q9DCK3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Tspan4Q9DCK3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Tspan4Q9DCK3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Tspan4Q9DCK3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Tspan4Q9DCK3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Tspan4Q9DCK3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Tspan4Q9DCK3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Tspan4Q9DCK3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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