Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCE5

Pak1ip1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak1ip1Q9DCE5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pak1ip1Q9DCE5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pak1ip1Q9DCE5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pak1ip1Q9DCE5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pak1ip1Q9DCE5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pak1ip1Q9DCE5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pak1ip1Q9DCE5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pak1ip1Q9DCE5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pak1ip1Q9DCE5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pak1ip1Q9DCE5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pak1ip1Q9DCE5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pak1ip1Q9DCE5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pak1ip1Q9DCE5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pak1ip1Q9DCE5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pak1ip1Q9DCE5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pak1ip1Q9DCE5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pak1ip1Q9DCE5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pak1ip1Q9DCE5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pak1ip1Q9DCE5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pak1ip1Q9DCE5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pak1ip1Q9DCE5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pak1ip1Q9DCE5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pak1ip1Q9DCE5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pak1ip1Q9DCE5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pak1ip1Q9DCE5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pak1ip1Q9DCE5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pak1ip1Q9DCE5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pak1ip1Q9DCE5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pak1ip1Q9DCE5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pak1ip1Q9DCE5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pak1ip1Q9DCE5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pak1ip1Q9DCE5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pak1ip1Q9DCE5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pak1ip1Q9DCE5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pak1ip1Q9DCE5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pak1ip1Q9DCE5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pak1ip1Q9DCE5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pak1ip1Q9DCE5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pak1ip1Q9DCE5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pak1ip1Q9DCE5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pak1ip1Q9DCE5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pak1ip1Q9DCE5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pak1ip1Q9DCE5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pak1ip1Q9DCE5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pak1ip1Q9DCE5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pak1ip1Q9DCE5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pak1ip1Q9DCE5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pak1ip1Q9DCE5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pak1ip1Q9DCE5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pak1ip1Q9DCE5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pak1ip1Q9DCE5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pak1ip1Q9DCE5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pak1ip1Q9DCE5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pak1ip1Q9DCE5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pak1ip1Q9DCE5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pak1ip1Q9DCE5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pak1ip1Q9DCE5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pak1ip1Q9DCE5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pak1ip1Q9DCE5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pak1ip1Q9DCE5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pak1ip1Q9DCE5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pak1ip1Q9DCE5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pak1ip1Q9DCE5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pak1ip1Q9DCE5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pak1ip1Q9DCE5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pak1ip1Q9DCE5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pak1ip1Q9DCE5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pak1ip1Q9DCE5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pak1ip1Q9DCE5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pak1ip1Q9DCE5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pak1ip1Q9DCE5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pak1ip1Q9DCE5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pak1ip1Q9DCE5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pak1ip1Q9DCE5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pak1ip1Q9DCE5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pak1ip1Q9DCE5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pak1ip1Q9DCE5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pak1ip1Q9DCE5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pak1ip1Q9DCE5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pak1ip1Q9DCE5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pak1ip1Q9DCE5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pak1ip1Q9DCE5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pak1ip1Q9DCE5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pak1ip1Q9DCE5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pak1ip1Q9DCE5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pak1ip1Q9DCE5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pak1ip1Q9DCE5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pak1ip1Q9DCE5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pak1ip1Q9DCE5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pak1ip1Q9DCE5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pak1ip1Q9DCE5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pak1ip1Q9DCE5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pak1ip1Q9DCE5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pak1ip1Q9DCE5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pak1ip1Q9DCE5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pak1ip1Q9DCE5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pak1ip1Q9DCE5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pak1ip1Q9DCE5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pak1ip1Q9DCE5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pak1ip1Q9DCE5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms