Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms