Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY5

Cbx6, Chromobox protein homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx6Q9DBY5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms