Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms