Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms