Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms