Protein–RNA interactions for Protein: Q9D920

Borcs5, BLOC-1-related complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs5Q9D920 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Borcs5Q9D920 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Borcs5Q9D920 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Borcs5Q9D920 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Borcs5Q9D920 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Borcs5Q9D920 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Borcs5Q9D920 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Borcs5Q9D920 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Borcs5Q9D920 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Borcs5Q9D920 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Borcs5Q9D920 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Borcs5Q9D920 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Borcs5Q9D920 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Borcs5Q9D920 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Borcs5Q9D920 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Borcs5Q9D920 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Borcs5Q9D920 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Borcs5Q9D920 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Borcs5Q9D920 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Borcs5Q9D920 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Borcs5Q9D920 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Borcs5Q9D920 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Borcs5Q9D920 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Borcs5Q9D920 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Borcs5Q9D920 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Borcs5Q9D920 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Borcs5Q9D920 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Borcs5Q9D920 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Borcs5Q9D920 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Borcs5Q9D920 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Borcs5Q9D920 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Borcs5Q9D920 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Borcs5Q9D920 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Borcs5Q9D920 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Borcs5Q9D920 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Borcs5Q9D920 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Borcs5Q9D920 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Borcs5Q9D920 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Borcs5Q9D920 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Borcs5Q9D920 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Borcs5Q9D920 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Borcs5Q9D920 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Borcs5Q9D920 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Borcs5Q9D920 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Borcs5Q9D920 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Borcs5Q9D920 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Borcs5Q9D920 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms