Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms