Protein–RNA interactions for Protein: Q9D735

Trir, Telomerase RNA component interacting RNase, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrirQ9D735 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrirQ9D735 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms