Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms