Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lonrf3Q9D4H7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms