Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clvs1Q9D4C9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms