Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms