Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms