Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2T6

1700034E13Rik, RIKEN cDNA 1700034E13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700034E13RikQ9D2T6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms