Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms