Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Snx7Q9CY18 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms