Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RpainQ9CWY9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms